发布日期:2018-07-05

本报电7月3日,在2018年全球海洋院所领导人会议上,青岛海洋科学与技术试点国家实验室发布海洋天然产物三维结构数据库,3.1万个海洋天然产物的准确三维结构等重要数据将向全球开放共享。

我国发布首个海洋天然产物三维结构数据库
原标题:我国发布首个海洋天然产物三维结构数据库电
7月3日,在“2018年全球海洋院所领导人会议”上,青岛海洋科学与技术试点国家实验室发布海洋天然产物三维结构数据库,3.1万个海洋天然产物的准确三维结构等重要数据将向全球开放共享。海洋是一个巨大的药源宝库,迄今为止,人们已经发现了约3万个结构新颖、活性多样的海洋天然产物。海洋试点国家实验室、青岛海洋生物医药研究院及中国海洋大学等多家单位,联合开发了首个海洋天然产物三维结构数据库,该数据库约含有3.1万个海洋天然产物的准确三维结构,可直接用于虚拟筛选与智能药物设计。“打造‘蓝色药库’是人类的共同事业,需要国际社会共同参与。我们开放数据库,希望为人类的健康事业造福。”海洋试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗表示,这个三维结构数据库是“蓝色药库”的基础数据库,将会提升海洋药物开发的速度与效率。据海洋试点国家实验室海洋创新药物筛选与评价平台主任杨金波介绍,全球范围内海洋药物研究遇到的主要问题就是资源获取问题,如何从数万个天然产物中筛选、开发新药是构建“蓝色药库”的关键。经过两年的时间,海洋试点国家实验室联合美国、英国、法国、澳大利亚等国家的18个团队、100多名专家协同攻关,通过从海洋微生物、矿物、动物当中提取天然产物,构建了精确的三维结构数据库。目前,海洋试点国家实验室已经完成170余个美国FDA批准的肿瘤药物靶点对海洋化合物数据库的精确筛选,发现1000余个具有开发前景的抗肿瘤药物苗头分子,经过有机合成、生物实测、药理药效分析和临床前试验,发现了诸多可开发为海洋药物的先导化合物,海洋药物筛选准确率由20%以下跃升到70%以上。海洋试点国家实验室高性能科学计算与系统仿真平台主任魏志强表示,海洋天然产物三维结构数据库的发布体现出几个方面的交叉。第一是平台的交叉。海洋试点国家实验室两个重要的平台——新药筛选平台、超算平台的交叉融合使得三维数据库的建设有了可能。第二个交叉是学科的交叉,药物的研发设计和信息领域的超级计算机的交叉。原来传统的一款新药的研发周期大概要10到15年,成本要10亿美元到15亿美元,通过超算则可以大大降低成本、缩短周期。这些交叉融合也是海洋试点国家实验室平台型效应的集中体现。《
人民日报 》

  近日,青岛海洋试点国家实验室海洋天然产物三维结构数据库(MarinChem
3D数据库)在全球海洋院所领导人会议上隆重发布,该数据库将向海内外开放并共享共用。

海洋是一个巨大的药源宝库,迄今为止,人们已经发现了约3万个结构新颖、活性多样的海洋天然产物。海洋试点国家实验室、青岛海洋生物医药研究院及中国海洋大学等多家单位,联合开发了首个海洋天然产物三维结构数据库,该数据库约含有3.1万个海洋天然产物的准确三维结构,可直接用于虚拟筛选与智能药物设计。

  该数据库是由海洋试点国家实验室携手青岛海洋生物医药研究院及中国海洋大学等单位,通过查询数万篇科技文献,归纳全球已发现的海洋天然产物,并总结30117个海洋天然产物的化学结构式,通过OPLS3力场优化与分子动力学模拟等方法,对化合物三维机构进行准确模拟。除此之外,数据库还收集了化合物的基本性质、来源及活性信息,且具有精确的检索功能,可以便捷的为各科研院所和制药企业用于创新药物开发工作,具有极大的应用价值和市场价值。该数据库的全球发布将逐步建立完善智能超算耦合生物实测的创新海洋药物虚拟筛选的技术体系,为实现中国“蓝色药库”开发的共同梦想迈出坚实的步伐。

打造蓝色药库是人类的共同事业,需要国际社会共同参与。我们开放数据库,希望为人类的健康事业造福。海洋试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗表示,这个三维结构数据库是蓝色药库的基础数据库,将会提升海洋药物开发的速度与效率。

据海洋试点国家实验室海洋创新药物筛选与评价平台主任杨金波介绍,全球范围内海洋药物研究遇到的主要问题就是资源获取问题,如何从数万个天然产物中筛选、开发新药是构建蓝色药库的关键。经过两年的时间,海洋试点国家实验室联合美国、英国、法国、澳大利亚等国家的18个团队、100多名专家协同攻关,通过从海洋微生物、矿物、动物当中提取天然产物,构建了精确的三维结构数据库。目前,海洋试点国家实验室已经完成170余个美国FDA批准的肿瘤药物靶点对海洋化合物数据库的精确筛选,发现1000余个具有开发前景的抗肿瘤药物苗头分子,经过有机合成、生物实测、药理药效分析和临床前试验,发现了诸多可开发为海洋药物的先导化合物,海洋药物筛选准确率由20%以下跃升到70%以上。

海洋试点国家实验室高性能科学计算与系统仿真平台主任魏志强表示,海洋天然产物三维结构数据库的发布体现出几个方面的交叉。第一是平台的交叉。海洋试点国家实验室两个重要的平台新药筛选平台、超算平台的交叉融合使得三维数据库的建设有了可能。第二个交叉是学科的交叉,药物的研发设计和信息领域的超级计算机的交叉。原来传统的一款新药的研发周期大概要10到15年,成本要10亿美元到15亿美元,通过超算则可以大大降低成本、缩短周期。这些交叉融合也是海洋试点国家实验室平台型效应的集中体现。

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